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藥學系現有專兼職教師42人，其中教授3人，副教授12人甘肅衛生職業學院，碩士生12人，“雙師型”教師21人甘肅衛生職業學院，占教師總數的50%。 實驗實訓導師4人，行業兼職教師21人。 根據專業建設需要，下設綜合中醫學、綜合藥學、藥理學三個學科組，負責院系教學、科研和課程建設。

藥學系現有39個教學班，其中中醫班10個，藥學班29個，學生總數1286人。

多年來，藥學系在人才培養過程中實行“教學一體”的教學模式，突出學生實踐能力、專業素質和人文精神的培養。 與甘肅省人民醫院、甘肅省第二人民醫院、甘肅省第三人民醫院、蘭州大學第一醫院、蘭州大學第二醫院、甘肅省中醫院、甘肅中醫藥大學附屬醫院長期合作省腫瘤醫院、甘肅省婦幼保健院、蘭州市第一人民醫院、蘭州市第二人民醫院、甘肅知仁同濟健康文化產業控股集團、德生堂、惠仁堂、中友藥業、蘭州佛慈制藥廠、蘭州制藥等20多家知名企業九州通藥業有限公司、蘭州新區科文旅游集團、杭州愛博、武漢五星、深圳泰泰等知名醫院和醫藥企業建立了“院企合作、勤工助學”的人才培養模式“產學融合、產教融合”，開展教學實習和崗位實習，為學生學習和就業奠定良好基礎。

長期以來，藥學系一直高度重視實驗室建設。 現有藥學實訓大樓一棟，擬建設中醫藥文化博覽館、藥物固體制劑GMP模擬制藥車間、藥理實訓中心等“六中心一展廳”。 、中藥及藥物化學培訓中心、藥物分析培訓中心、中藥理化性質鑒定中心、中藥炮制配制中心、靜態制劑中心。 設有精密儀器室、分析天平室、萃取分離操作室、培訓室和制劑室，配備高效液相色譜儀、薄層掃描儀、紫外分析儀等儀器設備。 完全能夠獨立完成基礎課、專業基礎課、專業課的實驗教學。

藥學系的培養目標是培養學生德、智、體、美、體全面發展，具有良好的職業素質、人際溝通與互動能力、熟練的藥學實踐技能，能夠從事藥品生產和銷售工作。各級各類醫療衛生機構和行業質量。 管理、維護、營銷、配藥和用藥指導方面熟練的制藥專業人員。